Απροστάτευτα τραύματα από κοψίματα και ζημιές από παγετό, καθώς και πληγές που προκύπτουν από παράσιτα διατροφής, μπορεί να γίνουν εστία βακτηριακής και μυκητιακής μόλυνσης. Μία από τις πιο κοινές ασθένειες σε παραμελημένους οπωρώνες και κήπους είναι ο καρκίνος του φλοιού Nectria galligena. Το σύμπτωμα αυτής της ασθένειας είναι καρκινικές αναπτύξεις στους κορμούς των οπωροφόρων δέντρων. Στα προσβεβλημένα κλαδιά, οι πληγές που διεισδύουν στο ξύλο είναι ορατές, καθώς και ο θάνατος παρακείμενων ιστών με ορατή ζώνη. Το φυτό επιδιώκει να κλείσει την πληγή δημιουργώντας ένα στρώμα από φλοιό και ξύλο, αλλά η ασθένεια εξελίσσεται και τελικά η πληγή δεν κλείνει. Τότε το δέντρο που δεν έχει υποστεί επεξεργασία πεθαίνει. Τα σπόρια των μανιταριών πέφτουν σε χειμερία νάρκη στις πληγές. Η μόλυνση εμφανίζεται μέσω πληγών, ρωγμών στο φλοιό, εκδορές από το δέσιμο αιώρων ή σχοινιών, απροστάτευτες τομές κ.λπ.Η πρόληψη ασθενειών που εμφανίζονται στους κορμούς και τους βλαστούς των οπωροφόρων δέντρων συνίσταται στην αφαίρεση και την καταστροφή των μολυσμένων δέντρων. Οι πληγές πρέπει να αλείφονται με αλοιφή κήπου, τεχνητό φλοιό ή αλοιφή με την προσθήκη μυκητοκτόνου Funaben. Θα πρέπει επίσης να θυμάστε να απολυμάνετε τα πριόνια, τα κλαδευτήρια και άλλα εργαλεία που χρησιμοποιούμε για τη φροντίδα των δέντρων.